Se utilizaron cuatro loci microsatélites para lograr la caracterización genética de seis poblaciones de Litopenaeus vannamei utilizadas para la acuicultura en Cuba: segunda generación de la primera introducción (S2-1), primera generación de la segunda (S1-2), de la tercera (S1-3) y de la cuarta (S1-4) y los cruces de dos poblaciones parentales: primera generación de la primera con primera generación de la tercera (S1-1 × S1-3) y primera generación de la segunda con primera generación de la tercera (S1-2 × S1-3). El 66% (16/24) de los sistemas genéticos del total de loci estaban en desequilibrio genético. Los cuatro loci microsatélites eran polimórficos para las seis poblaciones. Las mayores cantidades de variantes alélicas corresponden al locus Pvan 1758, que es a su vez aquel en el que hay alelos privados de la primera generación de la tercera. Todas las comparaciones Fst fueron significativas. Esto indica grandes diferencias entre poblaciones. Los valores más altos son aquellos en los que hay presencia de la segunda introducción. Esta introducción y sus descendientes son también más consanguíneas.
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