Resumen

Antecedentes. En comparación con la bien estudiada 5-metilcitosina (m5C) en el ADN, el papel y la topología del epitranscriptoma m5C siguen estando insuficientemente caracterizados. Resultados. Mediante el análisis de transcriptome toda la distribución m5C en humanos y de ratón, mostramos que la modificación m5C se enriquece significativamente en 5′ regiones no traducidas (5′UTRs) de ARNm en humanos y de ratón. Con un análisis comparativo del metiloma del ARNm y del ADN, demostramos que, al igual que la metilación del ADN, la metilación m5C del transcriptoma exhibe un fuerte efecto de agrupación. Sorprendentemente, se observa una correlación inversa entre la metilación m5C del ARNm y del ADN en los sitios CpG. Un análisis más detallado revela que el nivel de metilación m5C del ARN está positivamente correlacionado tanto con la expresión como con la vida media del ARN. También observamos que el nivel de metilación de los ARN mitocondriales es significativamente mayor que el de los ARN transcritos a partir del genoma nuclear. Conclusiones. Este estudio proporciona una caracterización topológica en profundidad de la modificación m5C en todo el transcriptoma asociando los patrones de metilación m5C del ARN con la expresión transcripcional, las metilaciones del ADN, las estabilidades del ARN y el genoma mitocondrial.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:ARNm, nivel de metilación m5C, patrones de metilación m5C, fuerte efecto de agrupación, transcriptoma metilación m5C, amplia distribución m5C, amplia modificación m5C, ADN, ARN, humano.
• Keywords:mRNA, m5C methylation level, m5C methylation patterns, strong clustering effect, transcriptome m5C methylation, wide m5C distribution, wide m5C modification, DNA, RNA, human