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Characterization and Comparative Analysis of RWP-RK Proteins from Arachis duranensis, Arachis ipaensis, and Arachis hypogaeaCaracterización y análisis comparativo de las proteínas RWP-RK de Arachis duranensis, Arachis ipaensis y Arachis hypogaea

Resumen

Las proteínas RWP-RK son factores importantes implicados en la respuesta al nitrato y el desarrollo de gametofitos en plantas, y las funciones de las proteínas RWP-RK se han analizado en muchas especies. Sin embargo, la caracterización de las proteínas RWP-RK del cacahuete es limitada. En este estudio, identificamos 16, 19 y 32 miembros RWP-RK de Arachis duranensis, Arachis ipaensis y Arachis hypogaea, respectivamente, e investigamos sus relaciones evolutivas. Las proteínas RWP-RK se clasificaron en dos grupos, proteínas de dominio RWP-RK y proteínas similares a NODULE-INCEPTION. Se compararon las distribuciones cromosómicas, las estructuras génicas y los motivos conservados de los genes RWP-RK entre cacahuetes silvestres y cultivados. Además, identificamos 12 pares de genes ortólogos de las dos especies de cacahuete silvestre, 13 de A. duranensis y A. hypogaea, y 13 de A. ipaensis y A. hypogaea. Se identificaron uno, uno y diecisiete pares de genes duplicados en los genomas de A. duranensis, A. ipaensis y A. hypogaea, respectivamente. Además, se encontraron diferentes números de elementos cis-actores en los promotores RWP-RK en especies silvestres y cultivadas (87 en A. duranensis, 89 en A. ipaensis y 92 en A. hypogaea) y, como resultado, muchos genes RWP-RK mostraron patrones de expresión distintos en diferentes tejidos. Nuestro estudio proporcionará información útil para futuros análisis funcionales y evolutivos de los genes RWP-RK.

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