Resumen

La secuencia completa del genoma de la soja brinda una oportunidad sin precedentes para descubrir los genes que controlan rasgos importantes. En particular, es prioritario analizar las posibles funciones de los genes reguladores. Se sabe que la familia de factores de transcripción bHLH (basic helix-loop-helix) interviene en el control de una amplia gama de sistemas críticos para la adaptación y la calidad de los cultivos, como la fotosíntesis, la señalización luminosa, la biosíntesis de pigmentos y el desarrollo de las vainas de las semillas. Mediante un algoritmo de búsqueda de modelos de Markov ocultos, se identificaron 319 genes con dominios de factores de transcripción de hélice-bucle-hélice básicos en la secuencia del genoma de la soja. Éstos se clasificaron en función de su potencial previsto de unión al ADN, su estructura intrón/exón y la filogenia del dominio bHLH. Se presentan pruebas de que la gran mayoría (281) de estos 319 genes bHLH de la soja se expresan a nivel de ARNm. De estos genes bHLH de la soja, el 67% existen en dos o más copias homeólogas. Este conjunto de datos proporciona un marco para futuros estudios sobre la función de los genes bHLH en la soja. El reto para futuras investigaciones sigue siendo definir las funciones de los factores bHLH codificados en el genoma de la soja, lo que puede permitir una mayor flexibilidad para la selección genética del crecimiento y la adaptación al medio ambiente en este cultivo tan extendido.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:soja, genes bHLH, hélice básica, dominios del factor de transcripción hélice, algoritmo de búsqueda del modelo oculto de Markov, función del gen bHLH, secuencia genómica completa, más copias homeólogas, desarrollo de la vaina de la semilla, secuencia genómica de la soja
• Keywords:soybean, bHLH genes, basic helix, helix transcription factor domains, hidden Markov model search algorithm, bHLH gene function, complete genome sequence, more homeologous copies, seed pod development, soybean genome sequence