A pesar de su papel crucial en el ciclo del nitrógeno, los ecosistemas de agua dulce se estudian relativamente poco en cuanto a los oxidantes activos del amoníaco (AO). Este estudio del lago Lucerna determinó la abundancia tanto de los genes amoA como de los transcritos de genes de las arqueas oxidantes del amoníaco (AOA) y de las bacterias (AOB) durante un periodo de 16 meses, arrojando más luz sobre el papel de ambos AO en un entorno lacustre alpino profundo. En la superficie, a 42 m de profundidad y en la capa de agua inmediatamente por encima del sedimento, las AOA superaron en general a las AOB. Sin embargo, en el agua superficial durante la estratificación de verano, cuando ambos AO eran poco abundantes, los AOB eran más numerosos que los AOA. Los patrones de distribución temporal de AOA y AOB eran comparables. Se observó una mayor abundancia de transcritos del gen amoA al inicio y al final de la estratificación estival. En verano, los genes y transcritos de las arqueas amoA se correlacionaron negativamente con la temperatura y la conductividad. Las concentraciones de amonio y oxígeno no variaron lo suficiente como para explicar la dinámica de los genes y transcritos de amoA. El zooplancton herbívoro observado puede haber causado un flujo oculto de amonio mineralizado y un cambio en la abundancia de genes y transcritos. En la superficie, la AO podría haber sido reprimida durante la estratificación estival debido a la limitación de nutrientes causada por el fitoplancton activo.
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