Se considera que las arqueas metanogénicas intestinales de los animales monogástricos están relacionadas con el metabolismo energético y la deposición adiposa del huésped; sin embargo, la información sobre su desarrollo en lechones jóvenes es limitada. Así pues, para investigar la colonización metanogénica temprana en las heces de lechones de Meishan y Yorkshire, se recogieron muestras fecales de lechones a los 1, 3, 7 y 14 días del nacimiento y se utilizaron para analizar la comunidad metanogénica con pirosecuenciación del gen 16S rRNA. Los resultados mostraron que la diversidad de la comunidad metanogénica en las heces de los lechones neonatos disminuyó desde el primer hasta el 14º día de edad, a medida que aumentaban las poblaciones totales de metanógenos. La edad de los lechones, pero no la raza, afectó significativamente a la diversidad de la comunidad metanogénica, que estaba dominada por el género Methanobrevibacter. Desde la edad de uno a 14 días, la abundancia de unidades taxonómicas operativas (UTO) relacionadas con M. smithii aumentó significativamente, mientras que las abundancias de UTO relacionadas con M. thaueri- y M. millerae disminuyeron significativamente. La sustitución de M. smithii por M. thaueri/M. millerae fue más rápida en los lechones de Yorkshire que en los de Meishan. Estos resultados sugieren que el establecimiento temprano de la microbiota en los lechones neonatales va acompañado de cambios drásticos en la comunidad metanogénica, y que los cambios varían entre cerdos de diferentes genotipos.
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