Contexto y Propósito: La evaluación precisa de los niveles y patrones de variabilidad genética y la identificación de diferencias resultantes de la selección natural pueden ser invaluables en la mejora del trébol rojo para diversas aplicaciones. El estudio se realizó para comparar la eficiencia de los marcadores morfológicos y de ADN polimórfico amplificado al azar (RAPD) en la evaluación de los cambios en cultivares de trébol rojo (Trifolium pratense L.) causados por la selección natural.
Materiales y Métodos: Se utilizaron tres cultivares de trébol rojo y sus selecciones, que habían sobrevivido durante tres años en una región montañosa. Los datos morfológicos y de RAPD fueron analizados mediante el software NTSYS-pc. Se compararon el número de marcadores detectados, los valores y rangos de distancias calculadas y los Análisis de Coordenadas Principales en 2D (2D PCoA) basados en ambas técnicas de marcadores.
Resultados: Aunque ambos métodos de marcadores indicaron diferencias entre cultivares y selecciones, los parámetros diferían en sus valores. El número de loci detectados por los marcadores RAPD fue mucho mayor que el determinado con rasgos morfológicos. Los valores y rangos de distancias morfológicas fueron más altos y amplios que los de las distancias moleculares. Los vectores propios del 2D PCoA basado en datos morfológicos explicaron una mayor parte de la variación total observada en el conjunto de datos.
Conclusiones: Cada conjunto de datos tiene sus propias fortalezas y limitaciones. Para estimaciones razonablemente precisas de la variabilidad genética y sus cambios bajo selección natural, se debe prestar adecuada atención a ambos métodos de marcadores.
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