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A Scalable Genetic Programming Approach to Integrate miRNA-Target Predictions: Comparing Different Parallel Implementations of M3GPUn Enfoque de Programación Genética Escalable para Integrar Predicciones de miARN-Objetivo: Comparando Diferentes Implementaciones Paralelas de M3GP

Resumen

Hay muchos enfoques de biología molecular para el análisis de microARN (miARN) e interacciones con los objetivos, pero los experimentos son complejos y costosos. Por esta razón, los enfoques computacionales in silico capaces de modelar estas interacciones moleculares son muy deseables. Aunque se han desarrollado varios métodos computacionales para predecir las interacciones entre miARN y genes objetivo, existen diferencias sustanciales en los resultados obtenidos ya que la mayoría de los algoritmos proporcionan un gran número de falsos positivos. Por lo tanto, los enfoques de aprendizaje automático son ampliamente utilizados para integrar predicciones obtenidas de diferentes herramientas. En este trabajo, adoptamos un método llamado GP multiclase multidimensional con poblaciones multidimensionales (M3GP), que se basa en un enfoque de programación genética, para integrar y clasificar resultados de diferentes herramientas de predicción de miARN-objetivo. Los resultados se comparan con los obtenidos con otros clasificadores, mostrando una precisión competitiva. Dado que nuestro objetivo es proporcionar predicc

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  • Idioma:Inglés
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Información del documento

  • Titulo:A Scalable Genetic Programming Approach to Integrate miRNA-Target Predictions: Comparing Different Parallel Implementations of M3GP
  • Autor:Beretta, Stefano; Castelli, Mauro; Muoz, Luis; Trujillo, Leonardo; Martnez, Yuliana; Popovi, Ale; Milanesi, Luciano; Merelli, Ivan
  • Tipo:Artículo
  • Año:2018
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Big Data Restricciones distribuidas Algoritmo de inferencia Gestión administrativa
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