Resumen

El objetivo de muchos estudios de microarrays es identificar genes que se expresan de manera diferencial entre dos clases o poblaciones. Muchos analistas de datos eligen estimar la tasa de descubrimiento falso (FDR) asociada con la lista de genes declarados como diferencialmente expresados. Estimar un FDR se reduce en gran medida a estimar , la proporción de genes expresados de manera diferencial entre todos los genes analizados. La estimación de generalmente se realiza a través de valores p, pero el cálculo de valores p puede considerarse una molestia y un paso potencialmente problemático. Evaluamos métodos para estimar directamente a partir de estadísticas de prueba, evitando la necesidad de calcular valores p. Adaptamos una metodología existente para estimar a partir de estadísticas t y F, de modo que pudiera ser estimado a partir de otras estadísticas. Comparamos la calidad de estas estimaciones con las estimaciones generadas por dos métodos establecidos para estimar a partir de valores p. En general, los métodos variaron ampliamente en sesgo y variabilidad. Las estim

• Materias:Lesión renal Diabetes Inhibidores Insuficiencia cardíaca Cardiopatía
• Subjects:Kidney injury Diabetes Inhibitors Heart failure Cardiopathy
• Palabras claves:Estudios de microarrays; Genes; Expresión diferencial; Tasa de falsos descubrimientos; FDR; Estadísticas de prueba
• Keywords:Microarray studies; Genes; Differentially expressed; False discovery rate; FDR; Test statistics