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Analysis of Similarity/Dissimilarity of DNA Sequences Based on Chaos Game RepresentationAnálisis de la similitud/diferencia de secuencias de ADN basado en la Representación del Juego del Caos.

Resumen

El Juego del Caos es un algoritmo que puede permitir producir imágenes de estructuras fractales. Considerando que las cuatro bases A, G, C y T de las secuencias de ADN pueden dividirse en tres clases según su estructura química, proponemos diferentes tipos de secuencias de caminata CGR. Basándonos en las coordenadas CGR de secuencias aleatorias, introducimos algunos invariantes para las secuencias primarias de ADN. Como aplicación, podemos realizar el examen de similitud/desigualdad entre el primer exón del gen de la -globina de diferentes especies. Los resultados indican que nuestro método es eficiente y puede obtener más información biológica.

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