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Analysis of Similarity/Dissimilarity of DNA Sequences Based on Chaos Game RepresentationAnálisis de la similitud/diferencia de secuencias de ADN basado en la Representación del Juego del Caos.

Resumen

El Juego del Caos es un algoritmo que puede permitir producir imágenes de estructuras fractales. Considerando que las cuatro bases A, G, C y T de las secuencias de ADN pueden dividirse en tres clases según su estructura química, proponemos diferentes tipos de secuencias de caminata CGR. Basándonos en las coordenadas CGR de secuencias aleatorias, introducimos algunos invariantes para las secuencias primarias de ADN. Como aplicación, podemos realizar el examen de similitud/desigualdad entre el primer exón del gen de la -globina de diferentes especies. Los resultados indican que nuestro método es eficiente y puede obtener más información biológica.

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DC.Title.spa
 Analysis of Similarity/Dissimilarity of DNA Sequences Based on Chaos Game Representation
DC.Title.eng
 Análisis de la similitud/diferencia de secuencias de ADN basado en la Representación del Juego del Caos.
DC.Creator
 Deng, Wei; Luan, Yihui
DC.Subject.snpi.spa
DC.Subject.snpi.eng
DC.Subject.spa
  •  Algoritmo; Estructuras fractales; Secuencias de ADN; Secuencias de caminata CGR; Invariantes; Información biológica
DC.Subject.eng
  •  Algorithm; Fractal structures; DNA sequences; CGR-walk sequences; Invariants; Biological information
DC.Description.spa
El Juego del Caos es un algoritmo que puede permitir producir imágenes de estructuras fractales. Considerando que las cuatro bases A, G, C y T de las secuencias de ADN pueden dividirse en tres clases según su estructura química, proponemos diferentes tipos de secuencias de caminata CGR. Basándonos en las coordenadas CGR de secuencias aleatorias, introducimos algunos invariantes para las secuencias primarias de ADN. Como aplicación, podemos realizar el examen de similitud/desigualdad entre el primer exón del gen de la -globina de diferentes especies. Los resultados indican que nuestro método es eficiente y puede obtener más información biológica.
DC.Source
 https://www.hindawi.com/journals/aaa/2013/926519
DC.Identifier.virtualpro
 http://www.revistavirtualpro.com/biblioteca/comparacion-de-secuencias-de-adn-usando-representacion-del-juego-del-caos-106495
DC.Identifier.issn-isbn
 ISSN:1085-3375
DC.Identifier.citacion
 Revista Virtual Pro, ,
DC.Language
 Inglés
DC.Relation
 
DC.Publisher
Hindawi Publishing Corporation
DC.Contributor
 
DC.Rights
 Derechos de autor:6
DC.Date
 2013
DC.Type
 Artículo
DC.Format
 pdf
DC.Identifier.file
https://downloads.hindawi.com/journals/aaa/2013/926519.pdf

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