Aunque podría decirse que las arqueas hipertermófilas tienen una gran necesidad de reparar eficazmente el ADN, carecen de miembros de varias familias de proteínas de reparación del ADN ampliamente conservadas entre bacterias y eucariotas. Por otra parte, los genes putativos de reparación del ADN que sí aparecen en estas arqueas no suelen generar el fenotipo esperado cuando se eliminan. La posibilidad de que las arqueas hipertermófilas tengan algunas estrategias únicas para hacer frente a los daños en el ADN y a los errores de replicación tiene un atractivo intelectual y tecnológico, pero para resolver esta cuestión será necesario proponer y probar experimentalmente mecanismos alternativos para hacer frente a los daños. Esta revisión evalúa una combinación de cuatro propiedades enigmáticas que distinguen a las arqueas hipertermófilas de todos los demás organismos: El estancamiento de la ADN polimerasa en dU, la aparente falta de NER convencional, la falta de homólogos de MutSL y la aparente esencialidad de las proteínas de recombinación homóloga. Las estrategias hipotéticas de afrontamiento del daño que podrían explicar este conjunto de propiedades pueden proporcionar nuevos puntos de partida para los esfuerzos por definir cómo las arqueas difieren de los modelos convencionales de reparación del ADN y de la fidelidad de la replicación.
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