En este artículo se propone el método espectral de Fourier Crank-Nicolson para resolver la ecuación de Schrödinger fraccional en el espacio con operadores de onda. La ecuación se trata con el método conservado de Galerkin de Fourier Crank-Nicolson y el método de colocación de Fourier Crank-Nicolson, respectivamente. Además, se estudia en detalle la capacidad del método numérico construido para mantener la conservación de masa y energía. Al mismo tiempo, se verifica la convergencia con precisión espectral en el espacio y precisión de segundo orden en el tiempo tanto para las aproximaciones de Galerkin como de colocación. Finalmente, los experimentos numéricos verifican las propiedades del esquema de diferencia conservativo y demuestran la corrección de los resultados teóricos.
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