Resumen

Con el fin de buscar secuencias de interés en el genoma de Coffea arabica var. Colombia, se construyó una biblioteca genómica en el vector Lambda FIX II (Stratagene) con un tamaño promedio de inserto de 15Kb y con un título de 1,33x10⁶ ufp/ml que representa aproximadamente 3,7 veces el genoma haploide. La biblioteca fue evaluada utilizando como sonda un producto de PCR amplificado con la combinación de iniciadores InhF - R631 y que presenta alta homología con secuencias tipo ubiquitinas de Arabidopsis thaliana y Oriza sativa. Se identificaron dos clones recombinantes (cof-ubi1 y cof-ubi2) que hibridizaron con la sonda tipo ubiquitina. Los resultados obtenidos indican que la biblioteca genómica es adecuada para la identificación de secuencias de interés, mapeo genético y estudios sobre regulación de la expresión de genes.

INTRODUCCIÓN

El café es uno de los principales productos de exportación agrícola en Colombia y representa una de las principales industrias en el país. De su producción, comercialización y procesamiento derivan el sustento un gran número de familias. La presencia de la broca en Colombia originó un gran interés hacia la búsqueda de fuentes de resistencia genética en el germoplasma de café existente. Con el desarrollo de la tecnología del DNA recombinante e ingeniería genética, es posible ampliar los métodos tradicionales de mejoramiento, haciéndolos más eficientes para la obtención de nuevos variantes genéticos. Además, permite adquirir nuevos conocimientos sobre la información genética asociada con caracteres básicos, ya sea en su estructura o en la regulación de su expresión (Kung y Wu, 1993).

La investigación relacionada con aspectos moleculares en café ha sido de vital importancia. Inicialmente, los estudios estuvieron relacionados con la construcción de mapas genéticos y la identificación de marcadores moleculares específicos asociados a características de interés agronómico tales como: resistencia a enfermedades y arquitectura de la planta, entre otros (Lashermes, et al., 2001 y Chaparro, 2000). Uno de los aspectos fundamentales para obtener mapas moleculares y poder realizar análisis físico de grandes regiones cromosómicas, así como el aislamiento de genes de interés, se basa en la disponibilidad de bibliotecas genómicas.

Una biblioteca genómica es una colección de fragmentos de DNA en la que se espera estén incluidas el mayor número de secuencias posibles de un genoma o las secuencias contenidas en un cromosoma (Alberts, et al., 1994). 

• Materias:Gestión de información Café Genética Café-cultivo
• Subjects:Information management Coffe Genetics Coffee - Harvesting
• Palabras claves:Biblioteca genómica; Clones genómicos; Coffea arabica; Ubiquitin
• Keywords:Coffea arabica; Genomic clones; Genomic library; Ubiquitin