Resumen

Antecedentes. Se ha confirmado que los microARN (miARN) intervienen en la aparición, el desarrollo y la prevención de la nefropatía diabética (ND), pero su mecanismo de acción aún no está claro. Objetivo. Con la ayuda de la base de datos GEO, se utilizan métodos bioinformáticos para explorar los pares de relaciones reguladoras miARN-ARNm relacionados con la nefropatía diabética y explicar sus posibles mecanismos de acción. Métodos. El conjunto de datos de microarrays de miARN relacionados con la DN (GSE51674) y el conjunto de datos de expresión de ARNm (GSE30122) se descargan a través de la base de datos GEO, se utiliza la herramienta de análisis en línea GEO2R para el análisis de expresión diferencial de datos, se utilizan las bases de datos TargetScan, miRTarBase y miRDB para predecir posibles genes diana corriente abajo regulados por miARN expresados diferencialmente, y se utiliza la intersección con genes diferenciales para obtener genes diana candidatos. De acuerdo con la relación reguladora entre miARN y ARNm, se clarifica el par de relaciones miARN-ARNm y se construye la red reguladora miARN-ARNm utilizando Cytoscape. DAVID se utiliza para realizar el análisis de enriquecimiento de funciones GO y el análisis de vías KEGG de los genes diana candidatos. Mediante la predicción GeneMANIA de genes diana de miARN y genes coexpresados, se construye la red de interacción proteica. Resultados y Conclusiones. Un total de 67 miRNAs expresados diferencialmente fueron examinados en el experimento, de los cuales 42 fueron regulados al alza y 25 fueron regulados a la baja; un total de 448 mRNAs expresados diferencialmente fueron examinados, de los cuales 93 fueron regulados al alza y 355 fueron regulados a la baja. Utilizando las bases de datos TargetScan, miRTarBase y miRDB para predecir las dianas de los miARN expresados diferencialmente, se predijo que 2283 genes diana coexistentes en 3 bases de datos se cruzaban con ARNm expresados diferencialmente para obtener 96 genes diana candidatos. Por último, se seleccionaron 44 pares de relaciones miARN-ARNm compuestos por 12 miARN expresados de forma diferencial y 27 ARNm expresados de forma diferencial; los análisis posteriores mostraron que los genes de la red reguladora de miARN pueden participar en la aparición y el desarrollo de la nefropatía diabética a través de la vía PI3K/Akt, la vía de interacción ECM-receptor y la vía de señalización RAS.

• Materias:Insuficiencia cardíaca Plataforma de servicios Filtro de orden óptimo Características clínicas Osteoporosis
• Subjects:Heart failure Platform services Optimal order filtering Clinical features Osteoporosis
• Palabras claves:genes diana candidatos, miARN, nefropatía diabética, miARN, ARNm, ARNm, base de datos GEO, bases de datos miRDB, análisis de enriquecimiento de funciones GO, herramienta de análisis en línea GEO2R
• Keywords:candidate target genes, miRNA, diabetic nephropathy, miRNAs, mRNA, mRNAs, GEO database, miRDB databases, GO function enrichment analysis, online analysis tool GEO2R