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Biochemical Frequency Control by Synchronisation of Coupled Repressilators: An In Silico Study of Modules for Circadian Clock SystemsControl de la frecuencia bioquímica mediante la sincronización de represores acoplados: Un estudio in silico de los módulos de los sistemas de reloj circadiano

Resumen

La exploración de los sistemas cronobiológicos surge como un campo de investigación creciente dentro de la bioinformática que se centra en diversas aplicaciones en medicina, agricultura y ciencias de los materiales. Desde la perspectiva de la biología de sistemas, se plantea la cuestión de si los sistemas de control biológico para la regulación de señales oscilatorias y sus homólogos técnicos utilizan mecanismos similares. De ser así, los enfoques de modelización y parametrización adoptados a partir de bloques de construcción pueden ayudar a identificar los componentes generales para el control de la frecuencia en los relojes circadianos, junto con la obtención de conocimientos sobre los mecanismos de sincronización del reloj con los estímulos externos, como el ritmo diario de la luz solar y la oscuridad. Los bucles de bloqueo de fase podrían ser un candidato interesante en este contexto. Tanto la biología como la ingeniería pueden beneficiarse de una visión unificada resultante de la modularización de los sistemas. En un primer estudio experimental, analizamos un modelo de represores acoplados. Demostramos su capacidad para sincronizar señales de reloj de forma monofrecuente. Varios osciladores se desvían inicialmente en diferencia de fase y frecuencia con respecto a las tasas de reacción y difusión explícitas. En consecuencia, la duración del proceso de sincronización depende de los parámetros de reacción y difusión dedicados, cuyos ajustes aún no han sido suficientemente capturados analíticamente.

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