Resumen

Antecedentes. Se ha confirmado que los microARN (miARN) participan en la aparición, el desarrollo y la prevención de la nefropatía membranosa (NM), pero su mecanismo de acción no está claro. Objetivo. Con la base de datos GEO y el uso de la bioinformática, se exploraron los genes de la red reguladora miARN-ARNm relevantes para la NM y se explicó su posible mecanismo de acción. Métodos. Se descargaron de la base de datos GEO el conjunto de datos de chips de miARN relacionados con la MN (GSE51674) y el conjunto de datos de chips de ARNm (GSE108109). El análisis diferencial se realizó utilizando la herramienta en línea GEO2R. Se utilizaron las bases de datos TargetScan, miRTarBase y StarBase para predecir los posibles genes diana corriente abajo regulados por miRNAs expresados diferencialmente, y se tomó la intersección con genes diferenciales para obtener genes diana candidatos. De acuerdo con la relación reguladora entre miARN y ARNm, se clarificó el par de relaciones miARN-ARNm y se utilizó Cytoscape para construir una red reguladora miARN-ARNm. Se utilizó WebGestalt para realizar el análisis de enriquecimiento del proceso biológico de los ARNm diferenciales en la red reguladora; FunRich analiza las vías de ARNm diferenciales en la red reguladora miARN-ARNm. Y la base de datos STRING se utilizó para construir una red PPI para genes diana candidatos, y Cytoscape analiza visualmente la red PPI. Resultados. Se llevaron a cabo experimentos para detectar miRNAs y mRNAs expresados diferencialmente. Hubo 30 miRNAs expresados diferencialmente, incluyendo 22 regulados al alza y 8 a la baja; y 1267 mRNAs expresados diferencialmente, incluyendo 536 regulados al alza y 731 a la baja. Utilizando las bases de datos TargetScan, miRTarBase y StarBase para predecir las dianas descendentes de los miARN expresados de forma diferencial, se predijo que 2957 genes diana descendentes coexistentes en las 3 bases de datos se cruzaban con ARNm expresados de forma diferencial para obtener 175 genes diana candidatos. Por último, se seleccionaron 36 pares de relaciones miARN-ARNm que comprendían 10 miARN expresados diferencialmente y 27 ARNm expresados diferencialmente, y se construyó la red reguladora. Otros análisis revelaron que los genes de la red reguladora miRNA pueden estar involucrados en el desarrollo de la nefropatía membranosa por mTOR, PDGFR-β, LKB1, y VEGF / VEGFR vías de señalización. Conclusiones. Los genes de la red reguladora miRNA pueden participar en la regulación de la autofagia podocyte, metabolismo de los lípidos, y la fibrosis renal a través de mTOR, PDGFR-β, LKB1, y VEGF / VEGFR vías de señalización, lo que afecta a la aparición y el desarrollo de la nefropatía membranosa.

• Materias:Insuficiencia cardíaca Plataforma de servicios Filtro de orden óptimo Características clínicas Osteoporosis
• Subjects:Heart failure Platform services Optimal order filtering Clinical features Osteoporosis
• Palabras claves:genes diana candidatos, genes de la red reguladora, miRNA, red reguladora, miRNAs, nefropatía membranosa, mRNA, mRNAs, MN, desarrollo
• Keywords:candidate target genes, regulatory network genes, miRNA, regulatory network, miRNAs, membranous nephropathy, mRNA, mRNAs, MN, development