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Quantification and Gene Expression Analysis of Histone Deacetylases in Common Bean during Rust Fungal InoculationCuantificación y análisis de la expresión génica de las histonas desacetilasas en judía común durante la inoculación del hongo de la roya

Resumen

Las histonas desacetilasas (HDAC) desempeñan un papel importante en el crecimiento, el desarrollo y los procesos de defensa de las plantas y son una de las causas principales de las modificaciones epigenéticas en un genoma. Antes de este proyecto, sólo se había publicado un estudio sobre las modificaciones epigenéticas de la judía común, un importante cultivo de leguminosas, y su interacción con el hongo patógeno de la roya Uromyces appendiculatus. Se midieron los niveles totales de HDACs activas en los tejidos de las hojas y se observaron los patrones de expresión de los genes HDAC seleccionados a las 0, 12 y 84 horas después de la inoculación en plantas inoculadas y simuladas. El análisis colorimétrico mostró que la cantidad total de HDACs presentes en el tejido foliar disminuyó a las 12 horas en las plantas inoculadas en comparación con las plantas de control inoculadas simuladamente. Los análisis de expresión génica indicaron que el patrón de expresión del gen PvSRT1 es similar a la tendencia del total de HDAC activas en este experimento de curso temporal. El gen PvHDA6 mostró una mayor expresión en las plantas inoculadas durante los puntos temporales medidos. Este es uno de los primeros intentos de estudiar los niveles de expresión de las HDACs en leguminosas de importancia económica en el contexto de las interacciones planta-patógeno. Los resultados de nuestro estudio serán útiles para comprender las tendencias de las HDACs activas totales y los patrones de expresión de estos genes en estudio durante el estrés biótico.

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Información del documento

  • Titulo:Quantification and Gene Expression Analysis of Histone Deacetylases in Common Bean during Rust Fungal Inoculation
  • Autor:Kalpalatha, Melmaiee; Venu (Kal), Kalavacharla; Adrianne, Brown; Antonette, Todd; Yaqoob, Thurston; Sathya, Elavarthi
  • Tipo:Artículo
  • Año:2015
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
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