Resumen

Antecedentes. En el desarrollo y la progresión del cáncer de mama intervienen mutaciones somáticas y de la línea germinal. Las tecnologías de genotipado de alto rendimiento y secuenciación de nueva generación han permitido descubrir variantes genéticas de riesgo y mutaciones somáticas adquiridas que impulsan la enfermedad. Sin embargo, no se han caracterizado las posibles interacciones oncogénicas entre las variantes genéticas de riesgo de la línea germinal y las mutaciones somáticas en el cáncer de mama triple negativo (CMTN) y en el cáncer de mama no triple negativo (CMNT). Aquí, delineamos las posibles interacciones oncogénicas entre genes que contienen mutaciones de línea germinal y somáticas en TNBC y no-TNBC e investigamos si existen diferencias en la expresión génica y la carga de mutación entre los dos tipos de cáncer de mama. Métodos. Abordamos este problema integrando la información sobre mutaciones de la línea germinal procedente de estudios de asociación del genoma completo con la información sobre mutaciones somáticas procedente de la secuenciación de nueva generación utilizando datos de expresión génica como fenotipo intermedio. Realizamos análisis de redes y vías para descubrir redes moleculares y vías de señalización enriquecidas para mutaciones de línea germinal y somáticas. Resultados. La investigación reveló firmas de genes con expresión diferencial y mutaciones somáticas diferenciales entre TNBC y no TNBC. Los análisis de redes y vías revelaron la existencia de genes relacionados funcionalmente que interactuaban en redes reguladoras de genes y múltiples vías de señalización enriquecidas para mutaciones somáticas y de línea germinal para cada tipo de cáncer de mama. Entre las vías de señalización descubiertas se incluyen las vías de reparación del ADN y de señalización de andrógenos y ATM para el TNBC y la respuesta al daño del ADN, los mecanismos moleculares del cáncer y las vías de señalización ATM y GP6 para el no TNBC. Conclusiones. Los resultados muestran que la genómica integrativa es un enfoque potente para delinear interacciones oncogénicas entre genes que contienen mutaciones de la línea germinal y genes que contienen mutaciones somáticas en TNBC y no TNBC y establece puentes funcionales putativos entre alteraciones genéticas y somáticas y las vías que controlan en los dos tipos de cáncer de mama.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genómica Inestabilidad genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Genomics Genomic instability Genetic polymorphism
• Palabras claves:mutaciones somáticas, línea germinal, vías, TNBC, genes, variantes genéticas de riesgo, cáncer de mama negativo, posibles interacciones oncogénicas, cáncer de mama, análisis de vías
• Keywords:somatic mutations, germline, pathways, TNBC, genes, genetic risk variants, negative breast cancer, possible oncogenic interactions, breast cancer, pathway analyses