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Los géneros Actinobacillus, Haemophilus y Pasteurella presentan una amplia ramificación polifilética en los árboles filogenéticos y no representan grupos coherentes de especies. En este estudio, hemos utilizado firmas moleculares identificadas mediante análisis genómicos comparativos junto con análisis filogenéticos basados en el genoma y en secuencias multilocus para aclarar los límites filogenéticos y taxonómicos de estos géneros. Hemos identificado grandes grupos de especies de Actinobacillus, Haemophilus y Pasteurella que representan a los miembros "sensu stricto" de estos géneros. Hemos identificado 3, 7 y 6 indels conservados (CSIs), que son compartidos específicamente por miembros sensu stricto de Actinobacillus, Haemophilus y Pasteurella, respectivamente. También hemos identificado dos conjuntos diferentes de CSI que son características únicas de los géneros Aggregatibacter y Mannheimia, respectivamente, que contienen patógenos. Ahora es posible delimitar los géneros Actinobacillus sensu stricto, Haemophilus sensu stricto y Pasteurella sensu stricto sobre la base de firmas moleculares discretas. Los demás miembros de los géneros Actinobacillus, Haemophilus y Pasteurella que no entran dentro de los clados "sensu stricto" y no contienen estas firmas moleculares deberían reclasificarse como otros géneros. Las CSI identificadas aquí también proporcionan objetivos diagnósticos útiles para la identificación de miembros actuales y nuevos de los géneros indicados.
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