Para analizar el comportamiento en estado estacionario y transitorio de CNA-II, se requirieron varias tareas. Se desarrollaron métodos y modelos en diversas áreas. Se desarrollaron y compararon modelos de red de HELIOS con los resultados de WIMS/MCNP5 generados por NA-SA. Las secciones transversales para el cálculo acoplado RELAP5/PARCS se extrajeron de HELIOS dentro del marco de GenPMAXS. La validación de HELIOS y PARCS se realizó principalmente mediante comparaciones con WIMS/PUMA y MCNP para modelos idealizados. Se desarrollaron métodos especiales para modelar los sistemas de barras de control e inyección de boro de CNA-II. La inserción de las barras es oblicua, y se añadió una rutina especial a PARCS para tratar este efecto. Se utilizaron resultados de CFD combinados con rutinas de mapeo especializadas para modelar el sistema de inyección de boro. En todos los casos hubo una buena concordancia en los resultados, lo que proporcionó confianza en los métodos y modelos de neutrones
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