Resumen

Los microARN son pequeños ARN no codificantes endógenos que desempeñan funciones críticas en la regulación génica. En el repertorio de miRBase se dispone de pocas secuencias de miRNAs de trigo (Triticum aestivum L.) y el conocimiento de sus funciones biológicas relacionadas con el estrés biótico es limitado. Hemos identificado 52 miRNAs, pertenecientes a 19 familias, a partir de datos de secuencias del transcriptoma de nueva generación basados en la búsqueda de homologías. Se identificó un nuevo miRNA específico de trigo que no pudo ser adscrito o asignado a ninguna familia de miRNAs conocida. Se encontraron 22 miRNAs expresados diferencialmente entre líneas casi isogénicas de trigo susceptibles y resistentes inoculadas con el patógeno de la roya de la hoja Puccinia triticina y comparadas con controles inoculados simulados. La mayoría de los miARNs fueron más regulados al alza en las NIL susceptibles en comparación con las NIL resistentes. Se identificaron 1306 genes diana potenciales para estos 52 miRNAs con funciones vitales en respuesta a estímulos, señalización y diversos procesos metabólicos y celulares. El análisis ontológico de genes mostró que 66, 20 y 35 genes diana se clasificaban en procesos biológicos, funciones moleculares y componentes celulares, respectivamente. Una red reguladora mediada por miARN reveló relaciones entre los componentes del targetoma. El presente estudio proporciona una visión de los miRNAs potenciales con funciones probables en la patogénesis de la roya de la hoja y sus genes diana en el trigo que establecen una base para futuros estudios.

• Materias:Genes Genética Molecular Ácido ribonucleico (ARN) Ácidos nucleicos Reparación del ADN
• Subjects:Genes Molecular Genetic Ribonucleic acid (RNA) Nucleic acids DNA Repair
• Palabras claves:mirnas, genes diana, pequeños rnas no codificantes endógenos, generación de datos de secuencias del transcriptoma, patógeno de la roya de la hoja puccinia triticina, análisis de ontología génica, triticum aestivum l., patogénesis de la roya de la hoja, genes diana potenciales, mirna específicos nuevos
• Keywords:mirnas, target genes, endogenous small noncoding rnas, generation transcriptome sequence data, leaf rust pathogen puccinia triticina, gene ontology analysis, triticum aestivum l., leaf rust pathogenesis, potential target genes, specific novel mirna