La tularemia, causada por la bacteria Francisella tularensis, en la que F. tularensis subespecie holarctica ha sido durante mucho tiempo la causa de una enfermedad endémica en partes del norte de Suecia. A pesar de ello, nuestra comprensión del ciclo de vida natural del organismo sigue siendo limitada. Durante tres años, recogimos muestras de aguas superficiales (n=341) y sedimentos (n=245) en dos zonas de Suecia con tularemia endémica. El cribado por PCR en tiempo real demostró la presencia de secuencias lpnA de F. tularenis en 108 (32%) y 48 (20%) de las muestras, respectivamente. Las secuencias de ARNr 16S de esas muestras se agruparon todas en la especie F. tularensis. El análisis de la región FtM19InDel de las muestras positivas para lpnA procedentes de puntos de muestreo seleccionados confirmó la presencia de secuencias específicas de la subespecie holarctica de F. tularensis. Estas secuencias se detectaron en muestras de agua tomadas tanto en años de brote como en años sin brote. Nuestros resultados indican que diversos organismos similares a F. tularensis, incluido F. tularensis subsp. holarctica, persisten en las aguas y sedimentos naturales de las zonas investigadas con tularemia endémica.
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