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Simultaneous Detection of Different MicroRNA Types Using the ZIP-Code Array SystemDetección simultánea de diferentes tipos de microARN mediante el sistema ZIP-Code Array

Resumen

Los microARN (miARN) son importantes reguladores negativos de la expresión génica. Su implicación en la tumorigénesis se basa en su desregulación en muchas enfermedades cancerosas humanas. Curiosamente, en las células tumorales se ha descrito una relación alterada entre los niveles de miARN precursor y maduro. En consecuencia, las diferencias en los niveles del tipo de miARN tienen un gran potencial como biomarcadores y la detección comparativa basada en el alto rendimiento podría permitir una caracterización más precisa de los subtipos, especialmente en el caso de entidades tumorales muy heterogéneas. Existen varios métodos moleculares para la detección de miARN maduros y precursores. Los microarrays de ADN están predestinados como método de alto rendimiento para la detección exhaustiva de miARNs en tumores. Sin embargo, la detección simultánea basada en arrays de estos dos tipos de miARN está limitada porque la secuencia del miARN maduro es idéntica en ambas formas. Aquí presentamos un sistema basado en microarrays de ADN de código ZIP en combinación con un novedoso enfoque de etiquetado, que permite la detección simultánea de miARN precursores y maduros en un único experimento. Utilizando plantillas sintéticas de miARN, demostramos la especificidad del método para los distintos tipos de miARN, así como el rango de detección de hasta cuatro órdenes de magnitud. Además, se detectaron y validaron miARN maduros y precursores en células tumorales humanas.

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