Resumen

Los oligonucleótidos formadores de tríplex (Triplex-forming oligonucleotides, TFOs) con esqueletos de ADN y ARN 2′-O-metil pueden dirigir fotoaductos de psoraleno a secuencias específicas de ADN. Sin embargo, se desconocen las consecuencias funcionales de estas diferentes estructuras sobre la fotorreactividad del psoraleno. Se diseñaron secuencias de TFO con ADN y 2′-O-metil ARN conjugados con psoraleno mediante enlaces de 2 carbonos y se examinó su capacidad para unirse y dirigir el daño a dúplex de ADN modelo correspondientes a secuencias del gen HPRT humano. Mientras que la afinidad de unión del TFO no se vio dramáticamente afectada por el tipo de columna vertebral, la fotoreactividad del psoraleno fue completamente abrogada por la columna vertebral de ARN 2′-O-metil. La fotorreactividad se restableció cuando el psoraleno se conjugó con el ARN TFO mediante un enlazador de 6 carbonos. A diferencia de la forma B del ADN de los tríplex formados por TFO de ADN, los espectros de CD de los tríplex formados con TFO de ARN 2′-O-metilado mostraban características de la forma A del ADN. Estos resultados indican que los TFO de ARN 2′-O-metil inducen una transición parcial de B a A en sus secuencias de ADN diana, lo que puede perjudicar la fotorreactividad de un psoraleno conjugado, y sugieren que el diseño óptimo de los TFO para atacar el daño del ADN puede requerir un equilibrio entre la capacidad de unión y la reactividad del fármaco.

• Materias:Pliegue de Proteína Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) Ácidos nucleicos Reparación del ADN Daño del ADN
• Subjects:Protein Folding Polymerase chain reaction Nucleic acids DNA Repair DNA Damage
• Palabras claves:metil rna tfos, esqueletos de metil rna, psoraleno, formar adn, fotorreactividad del psoraleno, gen hprt humano, esqueleto de metil rna, secuencias específicas de adn, secuencias diana de adn, adn
• Keywords:methyl rna tfos, methyl rna backbones, psoralen, form dna, psoralen photoreactivity, human hprt gene, methyl rna backbone, specific dna sequences, target dna sequences, dna