Resumen

La leishmaniasis sigue siendo una enfermedad tropical desatendida, que afecta a personas y animales y causa importantes pérdidas económicas. De ahí el interés por estudiar y evaluar nuevas dianas farmacológicas. De hecho, se ha demostrado que al interferir con proteínas lectoras de lisina como el bromodominio (BMD) se produce una disminución de la supervivencia del parásito. En este trabajo estudiamos la dinámica y la energética del BMD de L. donovani en complejo con bromosporina, que se considera un pan-inhibidor de BMDs, con el objetivo de comprender el mecanismo de reconocimiento molecular. La dinámica molecular (DM) y el cálculo de la energía libre de no-equilibrio guiado por simulaciones de dinámica molecular dirigida (SMD) mostraron que la BMD tiene tres regiones de aminoácidos flexibles y la bromosporina exhibe varios estados de reconocimiento durante la interacción. Una de las posibles razones es que la bromosporina es promiscua y es probable que interactúe favorablemente con varios bromodominios. Además, las interacciones Van der Waals tienen más relevancia en el reconocimiento de complejos y los residuos ASN-87 y TRP-93 son clave en la formación de interacciones hidrofóbicas y de enlaces H, respectivamente. La información obtenida es útil para comprender el mecanismo de reconocimiento, la dinámica y la energética del complejo para el desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas.

• Materias:Acetamida
• Subjects:Acetamida
• Palabras claves:Bromodominio; Bromosporina; Dinámica molecular; Energía libre
• Keywords:Bromodomain; Bromosporine; Molecular dynamics; Free energy