Resumen

El estudio de los conjuntos arqueológicos naturales requiere un contexto comunitario, es decir, una evaluación simultánea de la dinámica de las poblaciones arqueológicas, bacterianas y virales. Aquí, utilizamos análisis metagenómicos resueltos por tamaño de filtro para informar de la dinámica de 101 OTUs arqueas y bacterianas y 140 poblaciones virales a través de 17 muestras recogidas a lo largo de diferentes escalas de tiempo entre 2007 y 2010 en el lago hipersalino australiano Tyrrell (LT). Todas las muestras estaban dominadas por Archaea (75-95%). Las poblaciones arcaicas, bacterianas y virales resultaron ser dinámicas en escalas de tiempo de meses a años, y diferentes conjuntos virales estaban presentes en fracciones de tamaño planctónicas, en relación con las asociadas al huésped (activo y provirus). Los análisis de las regiones de repetición palindrómica corta agrupada y regularmente interespaciada (CRISPR) indican que tanto los virus raros como los abundantes fueron el objetivo, principalmente de los huéspedes de menor abundancia. Aunque muy pocos espaciadores tenían coincidencias con la base de datos NCBI nr o con las 140 poblaciones virales de LT, el 21% tenía coincidencias con lecturas de concentrados virales de LT no ensamblados. Esto sugiere una adaptación local a los virus específicos de los LT y/o un submuestreo de los conjuntos halovirales en las bases de datos públicas, junto con un exitoso mantenimiento mediado por CRISPR de las poblaciones virales en abundancias lo suficientemente bajas como para impedir el ensamblaje genómico. Este es el primer informe metagenómico que evalúa la dinámica generalizada de las arqueas a nivel de población en escalas de tiempo cortas en un sistema hipersalino.

• Materias:Células Minería Rellenos sanitarios Arqueas metanogénico
• Subjects:Cells Mining Landfills Archeas methanogenic
• Palabras claves:población viral, lago hipersalino tyrrell, ensamblaje arqueal natural, huésped de menor abundancia, ensamblaje viral diferente, lectura concentrada viral, lago hipersalino australiano, dinámica arqueal generalizada, base de datos ncbi nr, análisis metagenómico resuelto
• Keywords:viral population, hypersaline lake tyrrell, natural archaeal assemblage, lower abundance host, different viral assemblage, viral concentrate read, australian hypersaline lake, widespread archaeal dynamic, ncbi nr database, resolved metagenomic analysis