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Design of Fixed Points in Boolean Networks Using Feedback Vertex Sets and Model ReductionDiseño de Puntos Fijos en Redes Booleanas Utilizando Conjuntos de Vértices de Retroalimentación y Reducción de Modelo

Resumen

Los puntos fijos en las redes booleanas (BNs) representan tipos de células o estados de células y son importantes para determinar las características de las células. En cuanto al problema de control en los puntos fijos, es importante considerar el problema de cambiar los puntos fijos mediante el uso de estímulos externos (es decir, entradas de control). En este documento, proponemos dos métodos para diseñar puntos fijos. En primer lugar, se propone un método de diseño utilizando reducción de modelo. Utilizando el modelo reducido, el problema de ubicar puntos fijos puede ser reformulado como un problema de programación lineal entera. A continuación, consideramos el problema de diseño utilizando solo la estructura de grafo de una BN dada y derivamos algunos resultados. En ambos métodos, un conjunto de vértices de retroalimentación de un grafo dirigido juega un papel importante. Finalmente, se presenta un ejemplo biológico.

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