Drosophila melanogaster se ha convertido en un sistema modelo para estudiar las interacciones entre la inmunidad innata y los patógenos microbianos, pero muchos aspectos relativos a su comunidad microbiana y las interacciones con los patógenos siguen sin estar claros. En este estudio se recogieron D. melanogaster silvestres de frutas tropicales de Puerto Rico para comprobar cómo se distribuye la microbiota y comparar la diversidad cultivable de hongos y bacterias. Además, se investigó si las moscas son vectores potenciales de patógenos humanos y vegetales. Se aislaron dieciocho especies de hongos y doce especies de bacterias de moscas silvestres. Los microorganismos más abundantes identificados fueron la levadura Candida inconspicua y la bacteria Klebsiella sp. La levadura Issatchenkia hanoiensis fue significativamente más común internamente que externamente en las moscas. La riqueza de especies era mayor en los hongos que en las bacterias, pero la diversidad era menor en los hongos que en las bacterias. La composición microbiana de las moscas era similar interna y externamente. Se identificaron diversos patógenos oportunistas humanos y vegetales en las moscas, como Alcaligenes faecalis, Aspergillus flavus, A. fumigatus, A. niger, Fusarium equiseti/oxysporum, Geotrichum candidum, Klebsiella oxytoca, Microbacterium oxydans y Stenotrophomonas maltophilia. A pesar de su utilidad como sistema modelo, D. melanogaster puede ser vector de microorganismos que representan un riesgo potencial para la sanidad vegetal y la salud pública.
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