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Microbial Diversity and Biochemical Potential Encoded by Thermal Spring Metagenomes Derived from the Kamchatka PeninsulaDiversidad microbiana y potencial bioquímico codificados por metagenomas de manantiales termales derivados de la península de Kamchatka

Resumen

Las regiones volcánicas contienen una variedad de ambientes adecuados para los extremófilos. Este estudio se centró en evaluar y explotar la diversidad procariota de dos comunidades microbianas procedentes de diferentes manantiales termales de Kamchatkian mediante enfoques metagenómicos. Se tomaron muestras de un manantial termoacidófilo cerca del volcán Mutnovsky y de un manantial termófilo en la caldera de Uzon. El ADN ambiental para el análisis metagenómico se aisló de las muestras de sedimento recogidas mediante lisis celular directa. La composición de la comunidad procariota se examinó mediante el análisis de los genes 16S rRNA de las arqueas y las bacterias. Se obtuvo un total de 1235 secuencias del gen 16S rRNA que se utilizaron para la clasificación taxonómica. Los más abundantes en las muestras fueron los miembros de Thaumarchaeota, Thermotogae y Proteobacteria. En el manantial caliente de Mutnovsky dominaban el grupo de las aguas termales terrestres, Kosmotoga y Acidithiobacillus. En la Caldera de Uzón predominaban los miembros no cultivados del Grupo Crenarchaeotic Misceláneo y Enterobacteriaceae. Las restantes secuencias del gen 16S rRNA pertenecían a los Aquificae, Dictyoglomi, Euryarchaeota, Korarchaeota, Thermodesulfobacteria, Firmicutes y algunos posibles nuevos filos. Además, el ADN recuperado se utilizó para generar bibliotecas metagenómicas, que posteriormente se extrajeron en busca de genes que codifican enzimas lipolíticas y proteolíticas. Se identificaron tres nuevos genes que confieren actividad lipolítica y un gen que confiere actividad proteolítica.

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Información del documento

  • Titulo:Microbial Diversity and Biochemical Potential Encoded by Thermal Spring Metagenomes Derived from the Kamchatka Peninsula
  • Autor:Bernd, Wemheuer; Robert, Taube; Pinar, Akyol; Franziska, Wemheuer; Rolf, Daniel
  • Tipo:Artículo
  • Año:2013
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Células Minería Rellenos sanitarios Arqueas metanogénico
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