Los manglares se encuentran entre los ecosistemas costeros más diversos y productivos de las regiones tropicales y subtropicales. Las condiciones ambientales particulares de este bioma hacen que los manglares sean puntos calientes de diversidad microbiana, y las comunidades microbianas residentes desempeñan papeles esenciales en el mantenimiento del ecosistema. Recientemente, ha aumentado el interés por comprender la composición y la contribución de los microorganismos en los manglares. En el presente estudio, hemos analizado la diversidad y distribución de las arqueas en los sedimentos de los manglares tropicales de Sundarbans utilizando la secuenciación del gen 16S rRNA. La extracción de ADN de muestras de sedimentos y la aplicación directa de la secuenciación de amplicones del gen 16S rRNA dio como resultado aproximadamente 142 Mb de datos de tres áreas de manglares distintas (Godkhali, Bonnie camp y Dhulibhashani). El análisis taxonómico reveló el predominio de los filos Euryarchaeota y Thaumarchaeota (Grupo Marino I) en nuestro conjunto de datos. La distribución de los diferentes taxones arqueológicos y los respectivos análisis estadísticos (SIMPER, NMDS) revelaron un claro cambio de comunidad a lo largo de las estaciones de muestreo. Las estaciones de muestreo (Godkhali y Bonnie Camp) con un historial de mayor contaminación por hidrocarburos/petróleo mostraron un patrón de comunidad arqueológica diferente (dominado por haloarchaea) en comparación con la estación (Dhulibhashani) con un entorno casi prístino (dominado por metanógenos). Se indica que los patrones de la comunidad arqueológica de los sedimentos estaban influidos por las condiciones ambientales.
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