Resumen

Los genes que codifican los reguladores transcripcionales que contienen motivos VQ (VQ) y los factores de transcripción WRKY pueden participar por separado o conjuntamente en el crecimiento, el desarrollo y las respuestas al estrés abiótico y biótico de las plantas. En este estudio se identificaron 222 genes VQ y 645 genes WRKY en seis especies de Prunus. Basándose en topologías de árboles filogenéticos, los genes VQ y WRKY se clasificaron en 13 y 32 clados, respectivamente. Por lo tanto, al menos 13 copias del gen VQ y 32 copias del gen WRKY estaban presentes en el genoma del ancestro común de las seis especies de Prunus. Los pequeños picos similares en los valores de Ks para los genes VQ y WRKY sugieren que las dos familias de genes sufrieron duplicaciones recientes en las seis especies estudiadas. La mayoría de las relaciones Ka/Ks eran inferiores a 1, lo que implica que la mayoría de los genes VQ y WRKY habían sufrido una selección purificadora. Los valores de Pi fueron significativamente mayores en los genes VQ que en los genes WRKY, por lo que los genes VQ mostraron una mayor diversidad de nucleótidos en las seis especies. Se predijo que cuarenta y uno de los genes VQ de Prunus interactuaban con 44 de los genes WRKY, y los niveles de expresión de algunos pares de interacción VQ-WRKY previstos estaban significativamente correlacionados. Los patrones de expresión diferencial de los genes VQ y WRKY sugirieron que algunos podrían estar implicados en la regulación de la resistencia a los áfidos en P. persica y el desarrollo del fruto en P. avium.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genoma Genética vegetal Proteómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis genome Plant genetics Proteomics
• Palabras claves:Genes WRKY, especie Prunus, genes VQ, picos de valor Ks pequeños similares, patrones de expresión diferencial, genes VQ de Prunus, copias de genes VQ, copias de genes WRKY, factores de transcripción WRKY, respuestas al estrés biótico.
• Keywords:WRKY genes, Prunus species, VQ genes, Similar small Ks value peaks, Differential expression patterns, Prunus VQ genes, VQ gene copies, WRKY gene copies, WRKY transcription factors, biotic stress responses