Las arqueas oxidantes del amoníaco (AOA) desempeñan un papel importante en la oxidación del amoníaco en hábitats terrestres, marinos y geotérmicos, como confirman varios estudios centrados específicamente en esos entornos. Se sabe mucho menos sobre el papel ecológico de los AOA en las aguas dulces. Para alcanzar una alta resolución a nivel de la comunidad de Thaumarchaea, la sonda MGI-535 se diseñó específicamente para este estudio y se aplicó al análisis de hibridación in situ por fluorescencia y deposición catalizada de reporteros (CARD-FISH). A continuación, la aplicamos a un análisis fino de la diversidad y abundancia relativa de AOA en las capas más profundas del lago Maggiore oligotrófico, confirmando los resultados publicados anteriormente sobre la presencia de AOA, pero mostrando diferencias en la abundancia y distribución dentro de la columna de agua sin tendencias estacionales significativas con respecto a las bacterias. Además, el análisis filogenético de las bibliotecas de clones de AOA de las aguas profundas del lago y de un afluente del lago, el río Maggia, sugirió el origen fluvial de los AOA del hipolimnio profundo del lago.
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