El bioma del Cerrado corresponde a una extensa zona de Brasil y se considera un punto caliente de biodiversidad. Los incendios frecuentes son una característica natural de este bioma y tienen influencia en la estructura y composición de la vegetación. Sin embargo, las continuas acciones antropogénicas están promoviendo cambios en la frecuencia y estacionalidad de los incendios. A pesar de la alta biodiversidad del Cerrado, se conoce poco sobre su microbioma, con pocas publicaciones que describen algunos aspectos de las comunidades bacterianas y fúngicas encontradas en este bioma y casi ninguna referencia sobre las arqueas. En este estudio, describimos la diversidad de arqueas en los suelos del Cerrado sensu stricto, comparando las comunidades de arqueas de los suelos de un área protegida de los incendios durante mucho tiempo con una expuesta a incendios bienales, utilizando los genes 16S rRNA y amoA como marcadores moleculares. Casi todas las secuencias de ARNr 16S de ambas áreas estudiadas estaban afiliadas a I.1b y 1.1c Thaumarchaeota, grupos comúnmente detectados en ambientes terrestres. Se detectó una mayor abundancia relativa del subgrupo I.1b de thaumarchaeota en la zona frecuentemente quemada, aunque no se observaron diferencias estadísticamente significativas en la riqueza y diversidad del ARNr 16S de las arqueas entre las zonas investigadas. Muchas arqueas oxidantes del amoníaco (AOA) están afiliadas a este grupo, lo que es coherente con la mayor diversidad de amoA y el número de OTU detectados en el área quemada periódicamente. En conjunto, nuestros resultados sugieren que, aunque la riqueza y diversidad total de la comunidad arquea no parece diferir mucho entre las condiciones investigadas, las alteraciones en la cubierta de madera y la estructura de la vegetación causadas por los incendios frecuentes probablemente causen efectos a largo plazo en la diversidad de AOA en los suelos del Cerrado.
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