Resumen

Tanto los factores ambientales celulares como las modificaciones químicas afectan críticamente a las propiedades de los ácidos nucleicos. Sin embargo, la estructura y la estabilidad del ADN que contiene sitios abásicos en condiciones de aglomeración molecular que imitan a las células siguen sin estar claras. En este trabajo investigamos los efectos de la aglomeración molecular en la estructura y estabilidad de los cuadruplex G que incluyen un único sitio abásico. El análisis estructural mediante dicroísmo circular demostró que el apiñamiento molecular por PEG200 no afectaba a la topología de la estructura G-cuadruplex con o sin un sitio abásico. El análisis termodinámico demostró además que el grado de estabilización del G-cuadruplex por apiñamiento molecular disminuía con la sustitución de un sitio abásico por una sola guanina. Notablemente, encontramos que los efectos del apiñamiento molecular en el cambio de entalpía para la formación del G-quadruplex tenían una relación lineal con los efectos del sitio abásico dependiendo de su posición. Estos resultados son útiles para predecir la estructura y la estabilidad de los cuadruplex G con sitios abásicos en condiciones de imitación celular.

• Materias:Ingeniería genética Ácido desoxirribonucleico (ADN) Ácido ribonucleico (ARN) Pliegue de Proteína Genómica
• Subjects:Genetic engineering Deoxyribonucleic acid (DNA) Ribonucleic acid (RNA) Protein Folding Genomics
• Palabras claves:efectos de aglomeración molecular, estabilidad, estructura, sitio abásico, sitios abásicos, aglomeración molecular, efectos de sitio abásico, factores ambientales celulares, condiciones de aglomeración molecular, sitio abásico único
• Keywords:molecular crowding effects, stability, structure, abasic site, abasic sites, molecular crowding, abasic site effects, cellular environmental factors, molecular crowding conditions, single abasic site