Resumen

El nucleósido 2,2,4-triamino-5(2H)-oxazolona (Oz) puede ser el resultado de un daño oxidativo en los residuos de guanina del ADN. A pesar de las diferencias entre las tres polimerasas (Pol β, KF exo-, y Pol η) con respecto a los patrones de incorporación de nucleótidos opuestos a Oz, las tres polimerasas pueden incorporar guanina opuesta a Oz. Basándonos en cálculos ab initio, propusimos una estructura para un par de bases Oz:G estable. Para evaluar la estabilidad de cada par de bases que contiene Oz (Oz:G, Oz:A, Oz:C y Oz:T) durante la replicación del ADN, determinamos la eficiencia de la extensión del cebador catalizada por Pol β-, KF exo-- o Pol η más allá de cada par de bases. Con cada polimerasa, la extensión más allá de Oz:G fue más eficiente que la más allá de Oz:A, Oz:C, o Oz:T. Además, los estudios de desnaturalización térmica revelaron que el valor de T m para el dúplex que contenía Oz:G era significativamente mayor que los obtenidos para los dúplex que contenían Oz:A, Oz:C u Oz:T. Por lo tanto, los resultados de los cálculos ab initio junto con los de los ensayos de replicación del ADN y los experimentos de desnaturalización térmica apoyaron la conclusión de que Oz:G es el más estable de los pares de bases que contienen Oz.

• Materias:Genes Genética Molecular Ácido ribonucleico (ARN) Ácidos nucleicos Reparación del ADN
• Subjects:Genes Molecular Genetic Ribonucleic acid (RNA) Nucleic acids DNA Repair
• Palabras claves:cálculos ab initio, par de bases, ensayos de replicación de adn, par de bases g, valor t m, patrones de incorporación de nucleótidos, experimentos de desnaturalización térmica, estudios de desnaturalización térmica, pol, polimerasas
• Keywords:ab initio calculations, base pair, dna replication assays, g base pair, t m value, nucleotide incorporation patterns, thermal denaturation experiments, thermal denaturation studies, pol, polymerases