Resumen

Los promotores suelen contener cadenas asimétricas ricas en G y C, en las que las citosinas son propensas a la modificación epigenética mediante metilación (5-mC) y 5-hidroximetilación (5-hmC). Estas secuencias también pueden formar estructuras secundarias cuádruplex G (G4) o i-motif (iM). Aunque las secuencias necesarias para la modulación epigenética y la formación de iM/G4 son similares y pueden solaparse, es poco probable que coexistan. A pesar de que la 5-hmC es un producto de oxidación de la 5-mC, las dos bases modificadas se agrupan en loci distintos. Este estudio se centra en la intersección de la formación de G4/iM y la modificación de 5-hmC utilizando los sitios CpG del promotor del gen del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) y examina si la incorporación de 5-hmC en las estructuras iM/G4 tenía algún efecto fisicoquímico sobre la formación, la estabilidad o el reconocimiento por parte de la nucleolina o la porfirina catiónica, TMPyP4. No se observaron cambios notables en la formación o estabilidad de las estructuras iM y G4; sin embargo, se produjeron cambios en el reconocimiento por nucleolina o TMPyP4 con la modificación con 5-hmC, reduciéndose notablemente la unión de proteínas y compuestos a los G4 modificados con 5-hmC. Las estructuras G4/iM en el promotor del VEGF son dianas terapéuticas prometedoras para la terapia antiangiogénica, y este trabajo contribuye a una comprensión exhaustiva de sus principios rectores relacionados con el potencial control transcripcional y la orientación.

• Materias:Ingeniería genética Genética Molecular Ácido ribonucleico (ARN) Ácidos nucleicos
• Subjects:Genetic engineering Molecular Genetic Ribonucleic acid (RNA) Nucleic acids
• Palabras claves:estructuras g4, modificación hmc, factor de crecimiento endotelial vascular, control transcripcional potencial, tmpyp4, formación, nucleolina, reconocimiento, estabilidad, sitios cpg
• Keywords:g4 structures, hmc modification, vascular endothelial growth factor, potential transcriptional control, tmpyp4, formation, nucleolin, recognition, stability, cpg sites