El Cerrado es un bioma que corresponde al 24% del territorio de Brasil. Sólo recientemente se han investigado las comunidades microbianas de este bioma. Aquí describimos por primera vez la diversidad de las comunidades arqueas de los sedimentos de los lagos de agua dulce del Cerrado en la estación seca y en el período de transición entre la estación seca y la lluviosa, cuando se producen las primeras lluvias. Se construyeron bibliotecas de genes, utilizando cebadores específicos de Archaea para los genes 16S rRNA y amoA. El análisis reveló marcadas diferencias entre las comunidades de arqueas encontradas en las dos estaciones. Las Thaumarchaeota I.1a e I.1c se encontraron en mayor número en el periodo de transición, mientras que las Archaea MCG fueron dominantes en la estación seca. Los metanógenos sólo se encontraron en la estación seca. El análisis de las secuencias de ARNr 16S reveló una menor diversidad en el periodo de transición. Se detectaron secuencias de arqueas amoA en ambas estaciones, pero hubo más OTUs durante la estación seca. Estas secuencias estaban dentro del mismo cluster que el gen amoA de Nitrosotalea devanaterra. La prueba de análisis de coordenadas principales (PCoA) reveló diferencias significativas entre las muestras de las distintas estaciones. Estos resultados proporcionan información sobre la diversidad de arqueas en los sedimentos lacustres de agua dulce del Cerrado e indican que la lluvia es probablemente un factor que afecta a estas comunidades.
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