En todo el proceso de transformación genética hay muchos pasos "poco probables" involucrados, debido a obstáculos como la necesidad de introducir ADN en células vivas, o lograr que el ADN sea insertado en forma estable y funcional en los propios cromosomas de las células, haciendo viable su replicación. Además, no hay forma de controlar donde se ubicará el ADN extraño: podría no ser funcional, dependiendo del sitio de inserción, o podría afectar o anular la acción de algún gen importante de la planta.
Con estas ideas se introduce el tema de los desafíos en la biotecnología, una sección de este documento, que pretende ser una introducción a sus conceptos básicos, así como abordar los procesos básicos de la ingeniería genética y mostrar los temas desafiantes del área. El documento se divide en las siguientes secciones:
Se muestran ideas y conceptos básicos de cada uno de los temas, donde además se introducen gráficos para aclarar los diferentes conceptos.
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