Resumen

Se estima que entre el 10 y el 20% de todos los genes del genoma humano codifican proteínas de la superficie celular y, debido a su localización subcelular, estas proteínas representan excelentes dianas para el diagnóstico y la terapéutica del cáncer. Por lo tanto, es necesaria una caracterización precisa del conjunto de surfaceomas en diferentes tipos de tumores. Utilizando datos TCGA de 15 tipos de tumores diferentes y un nuevo método para identificar genes cancerígenos, el S-score, identificamos varias dianas terapéuticas potenciales dentro del conjunto surfaceome. Esto nos permitió ampliar un análisis previo nuestro y proporcionó una clara caracterización del surfaceoma humano en el panorama tumoral. Además, presentamos pruebas de que un conjunto de tres genes -WNT5A, CNGA2 e IGSF9B- puede utilizarse como firma asociada a una menor supervivencia en pacientes con cáncer de mama. Los datos aquí expuestos ayudarán a la comunidad a desarrollar herramientas diagnósticas y terapéuticas más eficaces para diversos tipos de tumores.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:el genoma humano codifica proteínas de la superficie celular, varias dianas terapéuticas potenciales, pacientes con cáncer de mama, diferentes tipos de tumores, datos TCGA, diagnóstico del cáncer, genes del cáncer, caracterización clara, diferentes tipos, dianas excelentes
• Keywords:human genome encode cell surface proteins, several potential therapeutic targets, breast cancer patients, different tumor types, TCGA data, cancer diagnosis, cancer genes, clear characterization, different types, excellent targets