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Bioinformatics Analysis of the Human Surfaceome Reveals New Targets for a Variety of Tumor TypesEl análisis bioinformático del surfaceoma humano revela nuevas dianas para diversos tipos de tumores

Resumen

Se estima que entre el 10 y el 20% de todos los genes del genoma humano codifican proteínas de la superficie celular y, debido a su localización subcelular, estas proteínas representan excelentes dianas para el diagnóstico y la terapéutica del cáncer. Por lo tanto, es necesaria una caracterización precisa del conjunto de surfaceomas en diferentes tipos de tumores. Utilizando datos TCGA de 15 tipos de tumores diferentes y un nuevo método para identificar genes cancerígenos, el S-score, identificamos varias dianas terapéuticas potenciales dentro del conjunto surfaceome. Esto nos permitió ampliar un análisis previo nuestro y proporcionó una clara caracterización del surfaceoma humano en el panorama tumoral. Además, presentamos pruebas de que un conjunto de tres genes -WNT5A, CNGA2 e IGSF9B- puede utilizarse como firma asociada a una menor supervivencia en pacientes con cáncer de mama. Los datos aquí expuestos ayudarán a la comunidad a desarrollar herramientas diagnósticas y terapéuticas más eficaces para diversos tipos de tumores.

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Información del documento

  • Titulo:Bioinformatics Analysis of the Human Surfaceome Reveals New Targets for a Variety of Tumor Types
  • Autor:André L., Fonseca; Vandeclécio L., da Silva; Marbella M., da Fonsêca; Isabella T. J., Meira; Thayná E., da Silva; José E., Kroll; André M., Ribeiro-dos-Santos; Cléber R., Freitas; Raimundo, Furtado; Jorge E., de Souza; Beatriz, Stransky; Sandro J., de Souza
  • Tipo:Artículo
  • Año:2016
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
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