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Comparative Genome Sequence Analysis Reveals the Extent of Diversity and Conservation for Glycan-Associated Proteins in Burkholderia spp.El análisis comparativo de la secuencia del genoma revela el grado de diversidad y conservación de las proteínas asociadas a glicanos en Burkholderia spp.

Resumen

Los miembros de la familia Burkholderia ocupan diversos nichos ecológicos. En los miembros patógenos de la familia, las proteínas asociadas a glicanos suelen estar vinculadas a funciones que incluyen la virulencia, el mantenimiento de la conformación proteica, el reconocimiento de superficies, la adhesión celular y la evasión del sistema inmunitario. El análisis comparativo de los genomas disponibles de Burkholderia ha revelado un conjunto básico de 178 proteínas asociadas a glicanos compartidas por todas las Burkholderia, de las cuales 68 son homólogas a genes esenciales conocidos. Las comparaciones de las secuencias genómicas revelaron la adquisición de genes específicos de cada especie mediante transferencias génicas, identificaron una proteína de la capa S y propusieron que las proteínas de superficie significativamente reactivas se asocian a moléculas de azúcar como medio potencial para eludir los mecanismos de defensa del hospedador. El análisis comparativo mediante una base de datos curada de consultas de búsqueda nos permitió conocer mejor el grado de conservación y diversidad, así como las posibles funciones asociadas a la virulencia de las proteínas asociadas a glicanos en miembros de Burkholderia spp. La lista curada de proteínas asociadas a glicanos utilizada también puede utilizarse para buscar homólogos asociados a glicanos en otros genomas.

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