Resumen

Las proteínas CCCH zinc finger, que se caracterizan por la presencia de tres residuos de cisteína y uno de histidina, desempeñan importantes funciones en el procesamiento del ARN en las plantas. Recientemente se ha demostrado que las proteínas CCCH de la subfamilia IX intervienen en la tolerancia al estrés. En este estudio, analizamos los genes CCCH IX en Zea mays, Oryza sativa y Sorghum bicolor. Estos genes, casi sin intrones, se dividieron en cuatro grupos según el análisis filogenético. El análisis de microsintaxis reveló microsintaxis en regiones de algunos pares de genes, lo que indica que la duplicación segmentaria ha desempeñado un papel importante en la expansión de esta familia de genes. Además, calculamos las fechas de duplicación mediante el análisis Ks, encontrando que todos los bloques de microsintenia se formaron después de la divergencia monocotiledónea-eudicotiledónea. Se demostró que se habían producido deleciones, multiplicaciones e inversiones a lo largo de la evolución. Además, los ratios Ka/Ks indicaron que los genes de estas tres especies de gramíneas están sometidos a una fuerte selección purificadora. Por último, investigamos los patrones evolutivos de algunos pares de genes que confieren tolerancia al estrés abiótico, sentando las bases para futuros estudios funcionales de estos factores de transcripción.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:pares de genes, proteínas CCCH zinc finger, Subfamilia IX de proteínas CCCH, genes CCCH IX, futuros estudios funcionales, genes, análisis Ks, ratios Ks, análisis de microsintacia, Oryza sativa
• Keywords:gene pairs, CCCH zinc finger proteins, Subfamily IX CCCH proteins, CCCH IX genes, future functional studies, genes, Ks analysis, Ks ratios, Microsynteny analysis, Oryza sativa