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Comparative Analysis and EST Mining Reveals High Degree of Conservation among Five Brassicaceae SpeciesEl análisis comparativo y la minería EST revelan un alto grado de conservación entre cinco especies de Brassicaceae

Resumen

Brassicaceae es una importante familia del reino vegetal que incluye varias plantas de gran importancia económica. Brassica spp. y Arabidopsis comparten una colinealidad muy conservada entre sus genomas que puede aprovecharse para la investigación genómica en cultivos de Brassicaceae. En este estudio, 131.286 ESTs de cinco especies de Brassicaceae se ensamblaron en contigs unigénicos y se compararon con los índices de genes de Arabidopsis. Casi todos los unigenes de las especies de Brassicaceae mostraron grandes similitudes con los genes de Arabidopsis, excepto los de B. napus, donde el 90% de los unigenes fueron similares. Se identificaron un total de 9.699 SSR en los unigenes. A partir de esta información se diseñaron cebadores PCR que se amplificaron entre especies para su validación. La anotación funcional de los unigenes mostró que la mayoría de los genes están presentes en las clases funcionales del metabolismo y la energía. Se espera que el análisis genómico comparativo entre Arabidopsis y las especies de cultivo relacionadas agilice la investigación en los genomas más complejos de Brassica. Esto sería útil tanto para la genómica como para los estudios evolutivos, y los marcadores de ADN desarrollados pueden utilizarse para la cartografía, el etiquetado y la clonación de genes importantes en Brassicaceae.

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Información del documento

  • Titulo:Comparative Analysis and EST Mining Reveals High Degree of Conservation among Five Brassicaceae Species
  • Autor:Jyotika, Bhati; Humira, Sonah; Tripta, Jhang; Nagender Kumar, Singh; Tilak Raj, Sharma
  • Tipo:Artículo
  • Año:2010
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Genoma Biología celular Citogenética Genómica Polimorfismo genético
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