Resumen

Para complementar las vías moleculares que contribuyen a la enfermedad de Parkinson (EP) e identificar biomarcadores potenciales, se compararon los perfiles de expresión genética de dos regiones de la médula entre pacientes con EP y controles. El GSE19587 que contiene dos grupos de perfiles de expresión genética [6 muestras del núcleo motor dorsal del vago (DMNV, por sus siglas en inglés) de pacientes con EP y 5 de controles, 6 muestras del núcleo olivar inferior (ION, por sus siglas en inglés) de pacientes con EP y 5 de controles] fue descargado del Gene Expression Omnibus. Como resultado, un total de 1569 y 1647 genes expresados diferencialmente (DEGs) fueron, respectivamente, examinados en DMNV y ION con el paquete limma de R. El análisis de enriquecimiento funcional por el servidor DAVID (la Base de Datos para Anotación, Visualización y Descubrimiento Integrado) indicó que los DEGs mencionados pueden estar involucrados en los siguientes procesos, tales como la regulación de la proliferación celular, la regulación positiva del proceso metabólico de macromoléculas, y la regulación de la apoptosis. Un análisis más detallado mostró que había 365 DEG comunes en ambas regiones (DMNV e ION), que pueden estar regulados por ocho grupos de microARN recuperados con WebGestalt. Los genes de la red reguladora común DEGs-miRNAs se enriquecieron en la regulación del proceso de apoptosis mediante el análisis DAVID. Estos hallazgos no sólo podrían avanzar en la comprensión de la patogénesis de la EP, sino también sugerir biomarcadores potenciales para esta enfermedad.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Polimorfismo genético Proteómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Genomics Genetic polymorphism Proteomics Computational biology
• Palabras claves:perfiles de expresión génica, pacientes con EP, DMNV, ION, regulación, DEGs comunes, biomarcadores potenciales, Gene Expression Omnibus, núcleo motor dorsal, análisis de enriquecimiento funcional
• Keywords:gene expression profiles, PD patients, DMNV, ION, regulation, common DEGs, potential biomarkers, Gene Expression Omnibus, dorsal motor nucleus, functional enrichment analysis