Resumen

La sequía es un importante estrés abiótico que reduce el desarrollo y el rendimiento del arroz. Se sabe que los miRNAs (microRNAs) median en la regulación postranscripcional bajo estrés por sequía. Aunque la importancia de los miRNAs individuales ha sido establecida, los cruces entre miRNAs y mRNAs permanecen sin desenterrar. Aquí se realizó un análisis de microarrays de miRNAs y los perfiles de expresión de ARNm emparejados del cultivar de arroz Nipponbare tratado por sequía. Las regulaciones miARN-ARNm que responden a la sequía se identificaron mediante una combinación de un enfoque de regresión de mínimos cuadrados parciales (PLS) y una predicción de objetivos basada en secuencias. Se construyó una red inducida por la sequía con 13 miARN y 58 ARNm diana, y se descubrieron cuatro módulos coreguladores de miARN. El análisis funcional sugirió que las dianas de miRNAs de respuesta a sequía están enriquecidas en señalización hormonal, metabolismo de lípidos y carbohidratos, y defensa antioxidante. Se validaron 13 miARN candidatos y genes diana mediante RT-qPCR, agrupación jerárquica y análisis ROC. Dos genes diana (DWARF-3 y P0651G05.2) de los módulos coreguladores de miARN se verificaron mediante RACE RLM-5′. En conjunto, nuestro estudio integrador de la interacción miRNA-mRNA proporcionó candidatos atractivos que ayudarán a dilucidar los mecanismos de respuesta a la sequía en Oryza sativa.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:Sequía, miRNA, miRNAs, módulos coreguladores, genes diana, perfiles de expresión de mRNA, estrés abiótico mayor, cultivar de arroz Nipponbare, Sequía, Análisis funcional.
• Keywords:drought, miRNA, miRNAs, coregulatory modules, target genes, mRNA expression profiles, major abiotic stress, rice cultivar Nipponbare, Drought, Functional analysis