Bacillus megaterium NCT-2 es una bacteria captadora de nitrato, que muestra una alta capacidad de biorremediación en suelos de salinización secundaria, incluyendo capacidad reductora de nitrato, solubilización de fosfato y adaptación a la salinidad. Para obtener información sobre la capacidad de biorremediación a nivel genético, se obtuvo la secuencia completa del genoma mediante una estrategia multiplataforma que incluía secuenciación HiSeq y PacBio. El genoma de NCT-2 consta de un cromosoma circular de 5,19 Mbp y diez plásmidos autóctonos, con un total de 5,88 Mbp y un contenido medio de GC del 37,87%. El cromosoma codifica 5.606 genes, 142 ARNt y 53 ARNr. En el genoma se identificaron genes implicados en las características de la biorremediación en suelos de salinización secundaria y la promoción del crecimiento de las plantas, como el metabolismo del nitrógeno, la captación de fosfato, la síntesis de ácidos orgánicos y fosfatasa para la capacidad de solubilización de fosfato, y el sistema sintético de IAA dependiente de Trp. Además, la cepa NCT-2 tiene una gran capacidad de adaptación al medio gracias a los genes implicados en los transportadores de cationes, el estrés osmótico y el estrés oxidativo. Este estudio arroja luz sobre la comprensión de las bases moleculares del uso de B. megaterium NCT-2 en la biorremediación de los suelos de salinización secundaria.
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