Resumen

Objetivo. Descifrar los cambios transcriptómicos y los genes relacionados con funciones potenciales contra la infección por el nucleopoliedrovirus Bombyx mori y aumentar la comprensión de la resistencia mejorada al virus del gusano de seda a nivel transcriptómico. Métodos. Se ensamblaron y anotaron los transcriptomas de las cepas Qiufeng (susceptible a la infección) y QiufengN (resistente a la infección) y se realizó un análisis comparativo con el fin de descifrar los cambios transcriptómicos y los genes relacionados con funciones potenciales contra la infección por BmNPV. Resultados. Se identificaron un total de 78.408 SNPs en la cepa Qiufeng del gusano de seda y 56.786 SNPs en la cepa QiufengN. Además, se encontraron nuevos eventos AS en estas 2 cepas. Además, se identificaron 1.728 DEGs en la cepa QiufengN en comparación con la cepa Qiufeng. Estos DEG estaban implicados en términos GO relacionados con la membrana, el metabolismo, la unión y la actividad catalítica, los procesos celulares y los sistemas del organismo. Los niveles más altos de representación génica se encontraron en la fosforilación oxidativa, el fagosoma, el ciclo TCA, el metabolismo de la arginina y la prolina, y el metabolismo del piruvato. Además, el análisis COG indicó que los DEG estaban implicados en "transporte y metabolismo de aminoácidos" y "transporte y metabolismo de carbohidratos". Conclusiones. Identificamos una serie de cambios patológicos importantes en el gusano de seda tras la infección y varias funciones estaban relacionadas con los mecanismos antivirales del gusano de seda.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:infección, gusano de seda, DEGs, metabolismo, cepa Qiufeng, cepa QiufengN, funciones potenciales, genes relacionados, cambios transcriptómicos, transporte de aminoácidos
• Keywords:infection, silkworm, DEGs, metabolism, Qiufeng strain, QiufengN strain, potential functions, related genes, transcriptomic changes, amino acid transport