Resumen

La cepa DH1 de Methanobrevibacter arboriphilus es un metanógeno autótrofo que se aisló de la madera húmeda de árboles que emiten metano. Esta especie ha despertado un gran interés por su inusual tolerancia al oxígeno y se ha estudiado como organismo modelo durante más de cuatro décadas. La cepa DH1 está estrechamente relacionada con otras especies de Methanobrevibacter asociadas al hospedador, procedentes del tracto intestinal de animales y del rumen, lo que convierte a esta cepa en un candidato interesante para el análisis comparativo con el fin de identificar factores importantes para la colonización de entornos intestinales. Aquí se presenta la secuencia del genoma de la cepa DH1 de M. arboriphilus. El borrador del genoma está compuesto por 2.445.031 pb con un contenido medio de GC de 25,44 Se ha predicho que alberga 1964 genes codificadores de proteínas. Entre los genes predichos, también hay más de 50 genes putativos para las llamadas proteínas similares a las adhesinas (ALP). La presencia de genes que codifican ALP en el genoma de este metanógeno no asociado al hospedador sugiere fuertemente que las superficies de destino para las ALP, además de los tejidos del hospedador, también deben ser consideradas como potenciales socios de interacción. La gran abundancia de ALP también puede indicar que este tipo de proteínas es más característico de grupos filogenéticos específicos de metanógenos, en lugar de ser indicativo de un entorno concreto en el que los metanógenos prosperan.

• Materias:Dióxido de carbono Genes Metabolismo (Bioquimica) Arqueas metanogénico
• Subjects:Carbon dioxide Genes Metabolism (Biochemistry) Archeas methanogenic
• Palabras claves:cepa arboriphilus dh1, madera húmeda de metano, grupo filogenético específico, socios potenciales de interacción, abundancia de alpes, presencia de alpes, contenido medio de gc, tracto del animal, tipo de proteína, tolerancia inusual al oxígeno
• Keywords:arboriphilus strain dh1, wetwood of methane, specific phylogenetic group, potential interaction partners, abundance of alps, presence of alps, average gc content, tract of animal, type of protein, unusual oxygen tolerance