Resumen

Toona sinensis Roem es una hortaliza de hoja muy popular en la cocina china y también se utiliza como medicina tradicional china. En este estudio, se recogieron muestras de hojas de la misma planta en dos fases de desarrollo y se utilizaron para la secuenciación de ARN de Illumina (RNA-Seq) de alto rendimiento. Mediante ensamblaje de novo se obtuvieron 125.884 transcritos y 54.628 unigenes. Un total de 25.570 pudieron ser anotados con funciones biológicas conocidas, lo que indicaba que las hojas y brotes de T. sinensis estaban experimentando múltiples procesos de desarrollo, especialmente para procesos metabólicos activos. El análisis de unigenes expresados diferencialmente entre las dos bibliotecas mostró que la biosíntesis de lisina era una vía KEGG enriquecida, y se identificaron genes candidatos implicados en la vía de biosíntesis de lisina en hojas y brotes de T. sinensis. Nuestros resultados proporcionan un análisis primario de los archivos de expresión génica de hojas y brotes de T. sinensis en diferentes etapas de desarrollo y ofrecen un valioso recurso para la investigación genética y genómica de la biosíntesis de lisina en plantas.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:T. sinensis, hoja de T. sinensis, Toona sinensis Roem, procesos metabólicos activos, ensamblaje de novo, diferentes etapas de desarrollo, vía KEGG enriquecida, archivos de expresión génica, vía de biosíntesis de lisina, múltiples procesos de desarrollo.
• Keywords:T. sinensis, T. sinensis leaf, Toona sinensis Roem, active metabolic processes, de novo assembly, different development stages, enriched KEGG pathway, gene expression files, lysine biosynthesis pathway, multiple developmental processes