Resumen

Hemos esclarecido la secuencia del genoma de Glycine max cv. Enrei con el fin de proporcionar una referencia para la caracterización de los cultivares japoneses de soja. La secuencia completa del genoma obtenida mediante un secuenciador de nueva generación se utilizó para el mapeo de referencia en el ensamblaje actual del genoma de G. max cv. Williams 82 obtenido por el Consorcio de Secuenciación del Genoma de la Soja en Estados Unidos. Tras secuenciar y ensamblar las lecturas shotgun del genoma completo, obtuvimos un conjunto de datos con unos 928 Mbs de bases totales y 60.838 modelos de genes. El análisis filogenético permitió vislumbrar las relaciones ancestrales de ambos cultivares y su divergencia del complejo que incluye a los parientes silvestres de la soja. Los modelos genéticos se analizaron en relación con rasgos asociados a la biosíntesis de antocianinas y flavonoides y con un perfil general del proteoma. Los datos de la secuencia están disponibles en DAIZUbase con el fin de proporcionar un recurso informático completo para la genómica comparativa de una amplia gama de cultivares de soja en Japón y una herramienta de referencia para la mejora de los cultivares de soja en todo el mundo.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:modelos genéticos, cultivares de soja, cultivares domésticos japoneses de soja, Consorcio de Secuenciación del Genoma de la Soja, G. max cv, Glycine max cv, recurso informático completo, ensamblaje actual del genoma, secuencia del genoma completo, escopeta de genoma completo
• Keywords:gene models, soybean cultivars, Japanese domestic soybean cultivars, Soybean Genome Sequencing Consortium, G. max cv, Glycine max cv, comprehensive informatics resource, current genome assembly, whole genome sequence, whole genome shotgun