El consorcio microbiano presente en los sistemas intestinales de los peces trabaja conjuntamente para lograr funciones específicas desconocidas. Hemos recogido peces guppy de aguas residuales contaminadas con hidrocarburos y metales traza para evaluar la relación entre la microbiota intestinal y la adaptación de los peces hospedadores. Se han utilizado genes diana y la secuenciación de amplicones de ARNr 16S para identificar las bacterias intestinales de los guppys. El medio acondicionado con minerales contribuye a identificar bacterias con capacidad para crecer y/o tolerar hidrocarburos y metales traza. Además, se evaluó la concentración inhibitoria mínima (CIM) de tolerancia a metales traza de la microbiota. En primer lugar, aislamos bacterias del sistema intestinal y demostramos que Bacillus spp., Staphylococcus spp., Shigella spp., Salmonella spp., Pseudomonas spp., Citrobacter spp., Salmonella enterica ssp.arizonae sp., Enterobacter spp. y Acinetobacter spp. forman parte de la microbiota intestinal del guppy. Algunas especies representativas son capaces de degradar y/o tolerar hidrocarburos de gasolina y/o gasóleo. Se observó tolerancia a metales traza en bacterias Gram-positivas y Gram-negativas. Demostramos que se ha encontrado una concentración inhibitoria mínima (CIM) de algunas microbiota aisladas de sistemas intestinales incluyendo para mercurio (Hg) entre 2 y 4‰, cobalto (Co) Co (2 y 5‰), zinc (Zn) (9 y 18‰), y plomb (Pb) (22 y 27‰). El Zn y el Pb fueron los metales traza para los que la tasa de tolerancia fue significativamente mayor. Por último, demostramos que la citocromo c oxidasa no interfiere en presencia de metales traza. El consorcio de trabajo demostró que las bacterias deben trabajar juntas para lograr lo mejor.
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